沉積地質(zhì)研究院前身是1985年由原地質(zhì)礦產(chǎn)部批準建立的成都地質(zhì)學院沉積地質(zhì)研究所，最早可追溯到1956年建立的成都地質(zhì)勘探學院地質(zhì)測量及找礦系巖石學教研室沉積巖教學組；1983年成都地質(zhì)學院組建地質(zhì)學系和地質(zhì)礦產(chǎn)勘查系，沉積巖教學組升格為沉積巖研究室，與巖石學教研室一起隸屬于地質(zhì)學系；1985年經(jīng)原地礦部批準，建立沉積地質(zhì)與礦產(chǎn)研究所，成為成都地質(zhì)學院二級教學科研機構(gòu)；2002年學校更名為成都理工大學后組建地球科學學院，沉積地質(zhì)研究所成為地球科學學院下屬的研究教學機構(gòu)；2005年經(jīng)成都理工大學批準成立沉積地質(zhì)研究院，目前是我國高等院校唯一一所專門從事沉積地質(zhì)學專業(yè)高層次人才培養(yǎng)和科學研究的機構(gòu)，是國內(nèi)本學科首批碩士、博士學位授權(quán)點，目前擁有地質(zhì)學一級學科博士授權(quán)點、地質(zhì)學、地質(zhì)資源與地質(zhì)工程兩個博士后流動站、2個省部級重點學科（沉積地質(zhì)學、古生物學與地層學）。沉積地質(zhì)研究院是“油氣藏地質(zhì)及開發(fā)工程”國家重點實驗室、“地質(zhì)學”世界一流學科、“地質(zhì)資源與地質(zhì)工程”和“礦產(chǎn)普查與勘探”國家重點學科、“資源勘查工程”國家級特色專業(yè)的重要支撐單位。

沉積地質(zhì)研究院下設沉積地質(zhì)研究室及實驗室、地層古生物研究室及實驗室兩個教學科研機構(gòu)、在北川縣桂溪鄉(xiāng)建有“龍門山泥盆系地質(zhì)實習基地”，與國家海洋局第二研究所共建“海洋科學研究院”、與中國石油化工股份公司共建“海相沉積與儲層研究聯(lián)合實驗室”，擁有價值2000余萬元的儀器設備，積累了大量典型成套的實驗教學文字及實物材料，資料室藏書萬余冊。沉積地質(zhì)研究院積極承擔國家和企業(yè)大型科研項目，近五年承擔省部級以上科研項目100余項，年均科研經(jīng)費超過4000萬元；編撰、出版沉積學和地層古生物學系列教材、參考書15部，其中獲國家級優(yōu)秀教材獎1項，部優(yōu)秀教材獎2項；科研成果獲國家自然科學二等獎1項，國家科技進步二等獎2項、三等獎1項，省部級一等獎3項、二等獎14項，三等獎18項，有力支撐和保障“地球科學”（國際ESI學科分類）學科ESI被引次數(shù)進入世界1%、“地質(zhì)學”進入世界一流學科建設行列。

在著名沉積地質(zhì)學家劉寶珺院士、曾允孚教授、王成善院士等學術(shù)與技術(shù)帶頭人的帶領下，沉積地質(zhì)研究院堅持以科學研究為依托，學科建設為龍頭，高層次人才培養(yǎng)為目標，水平立院、特色興院。經(jīng)過三十多年的建設與發(fā)展，在古地理重建、層序地層學與含油氣盆地分析、儲層沉積學、事件沉積學等領域形成了明顯優(yōu)勢和特色，培養(yǎng)了一大批地質(zhì)學高層次人才，活躍在教學、科研、國有大中型企業(yè)和政務管理等各條戰(zhàn)線上。