建筑學(xué)：

  是東南大學(xué)的傳統(tǒng)強(qiáng)勢(shì)學(xué)科，建立于1927年，是我國(guó)成立的第一個(gè)建筑系，實(shí)力雄厚，全國(guó)建筑院系通用的教材有近1/3由東大編寫，全國(guó)建筑方面的國(guó)家級(jí)重點(diǎn)學(xué)科東南大學(xué)就占了1/3，特別是中國(guó)古建筑歷史方面，東南大學(xué)的地位更是其他院校無可比擬的，在國(guó)內(nèi)一直處于領(lǐng)先地位。
教學(xué)上實(shí)行教授負(fù)責(zé)制和導(dǎo)師負(fù)責(zé)制，使學(xué)生在大一的時(shí)候就有機(jī)會(huì)與博導(dǎo)、院士等進(jìn)行學(xué)習(xí)，形成了鮮明的特色。

  信息工程：

  是東南大學(xué)的一大驕傲，2006年1月，東南大學(xué)研制出中國(guó)第一塊符合3G移動(dòng)通信技術(shù)規(guī)范的芯片，這宣告著我國(guó)躋身于世界移動(dòng)通信強(qiáng)國(guó)的行列，現(xiàn)在國(guó)家新一代移動(dòng)通信技術(shù)(4G)開發(fā)項(xiàng)目的總體負(fù)責(zé)人就是東南大學(xué)無線電工程系的尤肖虎教授。在未來五年，東南大學(xué)將建成移動(dòng)通信國(guó)家實(shí)驗(yàn)室。這里將成為我國(guó)移動(dòng)通信方面與世界其他通信強(qiáng)國(guó)抗衡的最為重要的陣地。

  土木工程：

  近幾年迅速發(fā)展壯大，并開始向交通運(yùn)輸工程、材料科學(xué)與工程、環(huán)境科學(xué)與工程、工程力學(xué)等領(lǐng)域拓展，蜚聲中外。學(xué)院教學(xué)與科研并重，設(shè)有為教學(xué)、科研服務(wù)的大型結(jié)構(gòu)試驗(yàn)室、預(yù)應(yīng)力實(shí)驗(yàn)室、力學(xué)實(shí)驗(yàn)室、水力學(xué)實(shí)驗(yàn)室、結(jié)構(gòu)力學(xué)實(shí)驗(yàn)室、環(huán)境工程實(shí)驗(yàn)室、計(jì)算機(jī)及CAD中心室和力學(xué)實(shí)驗(yàn)中心。擁有國(guó)內(nèi)歷史悠久、專業(yè)藏書豐富的土木工程圖書館和資料室。

  生物醫(yī)學(xué)工程：

  是東南大學(xué)依托傳統(tǒng)優(yōu)勢(shì)學(xué)科去發(fā)展交叉學(xué)科與邊緣學(xué)科的一次成功的創(chuàng)新，他們的數(shù)學(xué)和數(shù)學(xué)系的知識(shí)深度和難度不相上下，電子方面的課程也可與電子系的一較高低，除此之外還要在醫(yī)學(xué)院學(xué)習(xí)一年的醫(yī)學(xué)知識(shí)，真可謂是樣樣精通了，經(jīng)過這些年的努力，東南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)科已經(jīng)處于國(guó)內(nèi)同學(xué)科的領(lǐng)先地位。

  電子科學(xué)與技術(shù)：

  專業(yè)以寬口徑培養(yǎng)電類人才為主要特色，實(shí)行學(xué)生在低年級(jí)時(shí)先不分專業(yè)，高年級(jí)后，可根據(jù)自己的興趣、愛好及對(duì)各個(gè)學(xué)科的了解選擇校內(nèi)電類的任何專業(yè)，因材施教。