南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院的前身為中央大學(xué)醫(yī)學(xué)院，創(chuàng)建于1935年，1949年解放后改名為南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院，1951年劃歸部隊系統(tǒng)，1987年經(jīng)教育部（原國家教委）批準(zhǔn)重建，成為教育部直屬的第一所綜合性大學(xué)七年制醫(yī)學(xué)院。醫(yī)學(xué)院現(xiàn)任院長為國際著名腎臟病專家，我國杰出臨床醫(yī)學(xué)科學(xué)家，南京軍區(qū)南京總醫(yī)院副院長、中國工程院院士劉志紅教授。
本院現(xiàn)設(shè)臨床醫(yī)學(xué)（八年制）、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)（七年制）、口腔醫(yī)學(xué)（七年制）三個專業(yè)，擁有臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)兩個一級學(xué)科博士點及口腔醫(yī)學(xué)一個一級學(xué)科碩士點，有生理學(xué)、內(nèi)科學(xué)、外科學(xué)3個二級學(xué)科博士點和臨床醫(yī)學(xué)博士后流動站，其中普通外科學(xué)為國家重點學(xué)科。南大醫(yī)學(xué)院是中國內(nèi)地高校中唯一只設(shè)醫(yī)學(xué)碩士和博士專業(yè)、而不設(shè)本科專業(yè)的醫(yī)學(xué)院。醫(yī)學(xué)院現(xiàn)有南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院、南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬金陵醫(yī)院（南京軍區(qū)總院）、南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬口腔醫(yī)院等3所附屬三級甲等醫(yī)院。
本院辦學(xué)方針是小規(guī)模、研究型、國際化，目標(biāo)是培養(yǎng)未來醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才，辦學(xué)理念和人才培養(yǎng)獨具特色。2012年入選教育部“卓越醫(yī)生培養(yǎng)計劃-拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)計劃”，開始試辦八年制醫(yī)學(xué)教育，目標(biāo)是培養(yǎng)杰出的領(lǐng)導(dǎo)型臨床學(xué)家和醫(yī)學(xué)科學(xué)家，辦學(xué)理念和人才培養(yǎng)獨具特色。
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