安徽醫(yī)科大學研究生學院是安徽醫(yī)科大學研究生教育的主管部門，設有招生辦公室、培養(yǎng)辦公室、學位辦公室、年級辦公室、就業(yè)辦公室、總支辦公室、學院辦公室等科室。截至2006年9月，學?，F(xiàn)有藥理學、皮膚病與性病學、老年醫(yī)學、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、免疫學、內(nèi)科學、神經(jīng)病學、兒少衛(wèi)生與婦幼保健學8個博士學位授權學科和64個碩士學位授權學科，設有臨床醫(yī)學、藥學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學3個博士后科研流動站，具有臨床醫(yī)學專業(yè)碩士學位和公共衛(wèi)生專業(yè)碩士學位（MPH）授予權，還有1個七年制本碩連讀專業(yè)（臨床醫(yī)學）。
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