2022南京醫(yī)科大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù),生物醫(yī)學(xué)工程考研調(diào)劑信息：南京醫(yī)科大學(xué)是國(guó)家“雙一流”建設(shè)高校，首批教育部、國(guó)家衛(wèi)生健康委與江蘇省人民政府共建醫(yī)學(xué)院校，江蘇高水平大學(xué)建設(shè)高峰計(jì)劃a類(lèi)建設(shè)高校。

曹晨教授，1988年生，2022年2月年起任南京醫(yī)科大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程與信息學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師。計(jì)算機(jī)專(zhuān)業(yè)博士，2017-2021年加拿大計(jì)算機(jī)（生物信息）方向博士后。

我主要從事研究方向是生物信息（計(jì)算生物），利用計(jì)算機(jī)算法/統(tǒng)計(jì)方法開(kāi)發(fā)生物信息軟件/工具，希望你有科研熱情（最好有讀博打算）和一定的編程能力，背景可以是統(tǒng)計(jì)、計(jì)算機(jī)編程、機(jī)器學(xué)習(xí)、圖形圖像；或者背景為生物信息；希望你通過(guò)研究生階段學(xué)習(xí)可以在我課題組發(fā)表bioinformatics級(jí)別論文。


要求：
本科為雙一流建設(shè)高校，研究生成績(jī)330+；

如果是計(jì)算機(jī)/統(tǒng)計(jì)背景，需要你報(bào)考代碼08***開(kāi)頭，需要考試科目是數(shù)學(xué)+計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)（或者專(zhuān)業(yè)課考試科目涵蓋數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和算法）；

如果是生物信息背景，需要你報(bào)考代碼07***開(kāi)頭，考試科目為計(jì)算機(jī)+生物信息（或相近科目）。


我的郵箱：  chen.cao at ucalgary.ca

我的近三年第一作者/通訊作者論文列表如下：
[1] cao c, he j, mak l, perera d, kwok d, wang j, li m, mourier t, gavriliuc s, greenberg m, morrissy s, sycuro l, yang g, jeffares d, long q. reconstruction of microbial haplotypes by integration of statistical and physical linkage in scaffolding, molecular biology and evolution. 2021. doi: 10.1093/molbev/msab037. (if= 16.2, 中科院一區(qū)期刊)
[2] cao c, ding b, li q, kwok d, wu j, long q. power analysis of transcriptome-wide association study: implications for practical protocol choice. plos genetics. 2021. doi: 10.1371/journal.pgen.1009405. (自然指數(shù)期刊)
[3] cao c, wang j, devin k, cui f, zhang z, zhao d, li j, zou q. webtwas: a resource for disease candidate susceptibility genes identified by transcriptome-wide association study.  nucleic acids research. 2022. doi: https://doi.org/10.1093/nar/gkab957 (if= 17.0, 中科院一區(qū)期刊)
[4] cao c, mak l, jin g, gordon p, ye k, long q, presm: personalized reference editor for somatic mutation discovery in cancer genomics. bioinformatics. 2019. doi: 10.1093/bioinformatics/bty812. (中科院一區(qū)期刊)
[5] cao c, kwok d, edie s, li q, ding b, kossinna p, campbell s, wu j, greenberg m, long q. ktwas: integrating kernel machine with transcriptome-wide association studies improves statistical power and reveals novel genes. briefings in bioinformatics. 2020. doi: 10.1093/bib/bbaa270. (if =11.1, 中科院一區(qū)期刊)
[6] cao c, kossinna p, kwok d, qingrun zhang, long q. disentangling genetic feature selection and aggregation in transcriptome-wide association studies[j]. genetics. 2022. doi: 10.1093/genetics/iyab216. (1916 年創(chuàng)刊的遺傳學(xué)經(jīng)典期刊，2022年2月封面論文)
[7] cao c, greenberg m, long. wglink: reconstructing whole-genome viral haplotypes using l0+l1-regularization. bioinformatics. 2021. doi: 10.1093/bioinformatics/btab076. (中科院一區(qū)期刊)
[8] wei x, wu x, cheng z, wu q, cao c*, xu x*, shang h*, botanical drugs: a new strategy for structure-based target prediction. briefings in bioinformatics. 2021. doi: 10.1093/bib/bbab425. (*共同通訊，if =11.1, 中科院一區(qū)期刊)