2017年溫州醫(yī)科大學(xué)孫中生教授課題組考研調(diào)劑信息
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2017年溫州醫(yī)科大學(xué)孫中生教授課題組考研調(diào)劑信息 正文
溫州醫(yī)科大學(xué)基因組醫(yī)學(xué)研究院孫中生(院長(zhǎng))課題組招收碩士研究生調(diào)劑生溫州醫(yī)科大學(xué)基因組醫(yī)學(xué)研究院孫中生教授(院長(zhǎng))課題組基于國(guó)家發(fā)展戰(zhàn)略和十三五規(guī)劃(“腦科學(xué)與類腦研究”,“加速推進(jìn)基因組學(xué)等生物技術(shù)大規(guī)模應(yīng)用”),主要利用基因組學(xué)、生物信息學(xué)、醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等研究手段從事復(fù)雜疾病、特別是神經(jīng)精神類疾?。ɡ?,孤獨(dú)癥、智力低下)和癌癥的遺傳學(xué)機(jī)制研究。本課題組經(jīng)費(fèi)充足,已經(jīng)申請(qǐng)到多個(gè)國(guó)家級(jí)課題,具有各種生物學(xué)實(shí)驗(yàn)平臺(tái)、生物信息學(xué)分析平臺(tái)、具有良好的發(fā)展前景??茖W(xué)研究上,本課題組在導(dǎo)師和學(xué)生的共同努力下,取得了多項(xiàng)突破性成功:
1、首次發(fā)現(xiàn)并報(bào)道節(jié)律基因PER1和PER2;
2、開發(fā)二代測(cè)序可視化工具M(jìn)agicViewer和SplicingViewer,普通電腦可完成大數(shù)據(jù)可視化;
3、開發(fā)MicroRNA在線分析工具,被評(píng)為業(yè)內(nèi)最準(zhǔn)確的工具之一;
4、通過全外顯子測(cè)序鑒定到中國(guó)第一個(gè)孤獨(dú)癥致病基因ANK3;
5、通過高通量測(cè)序鑒定肌萎縮側(cè)索硬化癥致病基因SOD1;
6、開發(fā)了第一款全面的在線的甲基化分析軟件RRBS-Analyser;
7、開發(fā)了癲癇相關(guān)突變與基因數(shù)據(jù)庫(kù)EpilepsyGene;
8、開發(fā)了第一款在線分析新生突變的工具mirTrios;
9、基于新生突變,首先系統(tǒng)分析神經(jīng)精神疾病的共有基因和通路,并開發(fā)NPdenovo數(shù)據(jù)庫(kù);
10、開發(fā)低起始量,單精度的DNA甲基化圖譜的實(shí)驗(yàn)與分析方法MBRidge;
11、開發(fā)單細(xì)胞DNA甲基化圖譜的實(shí)驗(yàn)與分析方法Q-RRBS;
12、開發(fā)第一款RNA結(jié)合蛋白調(diào)控?cái)?shù)據(jù)庫(kù)RBP-Var;
13、首次使用全基因組測(cè)序分析中國(guó)自閉癥患者突變圖譜;
14、首次鑒定到多個(gè)自閉癥新基因并進(jìn)行了深入的分子機(jī)制研究;
本課題組在Cell, Molecular Psychiatry, PNAS, Nucleic Acids Research, Journal of Molecular Cell Biology, Genetics in Medicine等國(guó)際權(quán)威雜志。目前本課題組還有多個(gè)基因組學(xué),分子生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)的文章Science、Nature Genetics、Nature Neuroscience、Molecular Psychiatry、Annals of Neurology等雜志審稿。
調(diào)劑名額:
生物信息學(xué)、基因組學(xué)等方向2-3名,遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等方向1-2名,共計(jì)4-5名。
如有意向且符合條件者,請(qǐng)將簡(jiǎn)歷發(fā)送至郵件tianguolangzi@yahoo.com,我們會(huì)根據(jù)實(shí)際情況回復(fù)調(diào)劑生。
導(dǎo)師介紹:
孫中生教授簡(jiǎn)介如下:
博士,研究員,博士生導(dǎo)師,中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)表觀遺傳專業(yè)委員會(huì)主任,HormonesandBehavior雜志編委。1982年北京大學(xué)學(xué)士;1992年美國(guó)德克薩斯A&M大學(xué)博士;1993-1998年先后在德克薩斯大學(xué)安德生癌癥研究中心放射治療系、貝勒醫(yī)學(xué)院分子人類遺傳學(xué)系做博士后;1998-1999年任路易斯安那州立大學(xué)神經(jīng)科學(xué)中心助理教授、主任助理,同時(shí)任生物化學(xué)和遺傳系助理教授;1999-2005年在美國(guó)康奈爾大學(xué)任助理教授,威爾醫(yī)學(xué)院特護(hù)醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室主任;2005-2010年在中國(guó)科學(xué)院心理研究所行為遺傳學(xué)中心任研究員,2010年至今任北京生科院研究員。1997年,榮獲Science雜志十大科學(xué)突破,2006年入選中科院“百人計(jì)劃”,并入選“新世紀(jì)百千萬(wàn)人才工程”。
http://sourcedb.biols.cas.cn/cn/...130922_3936098.html
學(xué)生待遇:
1、每月發(fā)放不低于1300元的生活補(bǔ)貼;
2、所有在讀研究生均享受8000-10000元/年的助學(xué)金,可抵消全部學(xué)費(fèi);
3、研究生期間,學(xué)生均有自己獨(dú)立負(fù)責(zé)的課題,同時(shí)參與、合作課題組其他相關(guān)課題;
應(yīng)聘要求:
1.本次招生重點(diǎn)面對(duì)生物信息學(xué)、基因組學(xué)、遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等專業(yè);
2.同時(shí)歡迎有醫(yī)學(xué)、計(jì)算機(jī)、數(shù)學(xué)背景的畢業(yè)生;
3.良好的英語(yǔ)閱讀寫作及聽說交流能力;
4.吃苦耐勞,有探索精神,對(duì)生命科學(xué)研究有濃厚興趣;
5.有計(jì)算機(jī)操作、編程基礎(chǔ)者或者相關(guān)生物實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先;
6.碩士畢業(yè)后有意向繼續(xù)深造者優(yōu)先;
7.符合溫州醫(yī)科大學(xué)碩士研究生招生調(diào)劑條件:http://yjsy.wmu.edu.cn/
培養(yǎng)方案:
不用擔(dān)心基礎(chǔ),只要你不荒廢時(shí)間,師兄師姐帶你進(jìn)步。前半年可能在溫州修完所有課程,后面所有學(xué)生都有機(jī)會(huì)到北京中科院學(xué)習(xí)和工作,進(jìn)行聯(lián)合培養(yǎng)。我們對(duì)入學(xué)的同學(xué)進(jìn)行集中培訓(xùn),包括入門和進(jìn)階。在培訓(xùn)方面,我們積累到足夠多的經(jīng)驗(yàn)。等打好基礎(chǔ)后,我們根據(jù)喜好分配你擅長(zhǎng)的任務(wù)和課題。天道酬勤,有付出才有收獲。
三年結(jié)束后,大致兩條路。
1、繼續(xù)讀博:
a)、優(yōu)秀碩士生可直接進(jìn)入中科院攻讀博士學(xué)位(導(dǎo)師在中科院也招生);
b)、優(yōu)秀碩士畢業(yè)生可推薦進(jìn)入中南大學(xué)、東南大學(xué)等其他國(guó)內(nèi)一流大學(xué)攻讀博士學(xué)位;
2、工作:
我們會(huì)讓你在碩士期間得到充分的鍛煉,將生物信息學(xué)技術(shù)運(yùn)用到爐火純青的地步,包括但不限于精通shell,R處理數(shù)據(jù)及作圖,Python和perl分析處理大數(shù)據(jù),PHP建站,MySQL建立數(shù)據(jù)庫(kù),PS等。生物信息工程師目前的薪資,可以自己查。我們實(shí)驗(yàn)室出去的學(xué)生的月薪一萬(wàn)起步。
學(xué)術(shù)成果:
2017年:
Yan Wang, Huijie Liu, Zhongsheng Sun.Lamarck rises from his grave: parental environment-induced epigenetic inheritance in model organisms and humans.Biological Reviews , 2017.
Zhuang Miao, Fengbiao Mao ,Moshe Szyf,Yan Wang,Zhong Sheng Sun Anxiety-Related Behaviours Associated with microRNA-206-3p and BDNF Expression in Pregnant Female Mice Following Psychological Social Stress. Molecular Neurobiology, 2017.(IF= 5.397)
2016年:
Jianing Zhong, Xianfeng Li, Wanshi Cai, Shanshan Dong, Jie Yang, Jian 'an Zhang, Nana Wu, Yuanyuan Li, Mao Fengbiao, Cheng Zeng, Jinyu Wu, Xingzhi Xu, Zhongsheng Sun.TET1 modulates H4K16 acetylation by controlling auto-acetylation of hMOF to affect gene regulation and DNA repair function.Nucleic Acids Research ,2016.(IF= 9.202)
Weiping Tian, Jiesi Wang, Ke Zhang, Huajing Teng, Chong Li, Moshe Szyf, Zhong Sheng Sun & Mei Zhao. Demethylation of c-MYB binding site mediates upregulation of Bdnf IV in cocaine-conditioned place preference OPEN. Scientific Reports, 2016. (IF=5.578)
Fengbiao Mao, Luoyuan Xiao, Xianfeng Li, Jialong Liang, Huajing Teng, Wanshi Cai, and Zhong Sheng Sun. RBP-Var: a database of functional variants involved in regulation mediated by RNA-binding proteins. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2016. (IF= 9.202)
2015年:
Li JC, Cai T, Jiang Y, Chen HQ, He X, Chen C, Li XF, Shao QZ, Ran X, Li ZS, Xia K, Liu CY, Sun ZS, Wu JY. Genes with de novo mutations are shared by four neuropsychiatric disorders discovered from NPdenovo database. Molecular Psychiatry, 2015. (IF=15.147)
Wanshi Cai , Fengbiao Mao , Huajing Teng, Tao Cai, Fangqing Zhao, Jinyu Wu and Zhong Sheng Sun. MBRidge An accurate and cost-effective method for profiling DNA methylome at single-base resolution. Journal of Moleucular Cell Biology, 2015. (IF=6.771)
Kangli Wanga, Xianfeng Libc, Shanshan Donga, Jialong Liangbd, Fengbiao Maobd, Cheng Zengb, Honghu Wua, Jinyu Wuab, Wanshi Caib & Zhong Sheng Sunab. Q-RRBS A quantitative reduced representation bisulfite sequencing method for single-cell methylome analyses. Epigenetics, 2015. (IF=4.780)
2014年:
Yan Wang, Guiling Li, Fengbiao Mao, Xianfeng Li, Qi Liu, Lin Chen, Lu Lv, Xin Wang, Jinyu Wu, Wei Dai, Guan Wang, Enfeng Zhao, Kai-Fu Tang and Zhong Sheng Sun. Ras-induced Epigenetic Inactivation of the RRAD Ras-related Associated with Diabetes Gene Promotes Glucose Uptake in a Human Ovarian Cancer Model. JURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2014. (IF=4.573)
Qing Xie , Qi Liu , Fengbiao Mao, Wanshi Cai, Honghu Wu, Mingcong You, Zhen Wang, Bingyu Chen, Zhong Sheng Sun , Jinyu Wu . A Bayesian Framework to Identify Methylcytosines from High-Throughput Bisulfite Sequencing Data. PLOS Computational Biology, 2014. (IF=4.620)
Xia Ran, Jinchen Li, Qianzhi Shao, Huiqian Chen, Zhongdong Lin, Zhong Sheng Sun and Jinyu Wu. EpilepsyGene: a genetic resource for genes and mutations related to epilepsy. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014. (IF=9.112)
2013年:
Jinyu Wu, Qi Liu, Xin Wang, Jiayong Zheng, Tao Wang, Mingcong You, Zhong Sheng Sun &Qinghua Shi. mirTools 2.0 for non-coding RNA discovery profiling and functional annotation based on high-throughput sequencing. RNA Biology, 2013. (IF=4.974)
Tao Wang, Qi Liu, Xianfeng Li, Xiaobing Wang, Jinchen Li, Xiaochun Zhu, Zhong Sheng Sun, Jinyu Wu. RRBS-Analyser A Comprehensive Web Server for Reduced Representation Bisulfite Sequencing Data Analysis. HUMAN MUTATION, 2013. (IF=5.144)
Zhanjun Wang, Wanshi Cai, Fang Cui, Tao Cai, Zhaohui Chen, Fengbiao Mao, Huajing Teng, Lin Chen, Jiesi Wang, Zhongsheng Sun, Xusheng Huang, Ping Yu. Identification of a novel missense C7W mutation of SOD1 in a large familial amyotrophic lateral sclerosis pedigree. NEUROBIOLOGY OF AGING, 2013. (IF=5.013)
Yongqing Wang1, Yan Wang1, Qi Liu, Gang Xu, Fengbiao Mao, Tingting Qin, Huajing Teng, Wanshi Cai, Ping Yu, Tao Cai, Mei Zhao, Zhong Sheng Sun, Congying Xie. Comparative RNA-Seq analysis reveals potential mechanisms mediating the conversion to androgen independence in an LNCaP progression cell model. CANCER LETTERS, 2013. (IF=5.621)
2012年:
Cheng Bi, Jinyu Wu, Tao Jiang, Qi Liu, Wanshi Cai, Ping Yu, Tao Cai, Mei Zhao, Yong-hui Jiang, and Zhong Sheng Sun.Mutations of ANK3 identified by exome sequencing are associated with Autism susceptibility. HUMAN MUTATION, 2012. (IF=5.144)
Jinyu Wu, Enjian Shen, Dashuang Shi, ZhongSheng Sun & Tao Cai. Identification of a novel Cys146X mutation of SOD1 in familial amyotrophic lateral sclerosis by whole-exome sequencing. GENETICS IN MEDICINE 2012. (IF=7.329)
2011年:
Jianmin Wu1, Gang Wu, Lu Lv, Yong-Feng Ren, Xue-Jiao Zhang, Yong-Feng Xue, Guiling Li, Xincheng Lu, ZhongSheng Sun and Kai-Fu Tang. MicroRNA-34a inhibits migration and invasion of colon cancer cells via targeting to Fra-1. CARCINOGENESIS, 2011. (IF=5.334)
2010年:
Huabin Hou, Fangqing Zhao, LingLin Zhou, Erle Zhu, Huajing Teng, Xiaokun Li, Qiyu Bao, Jinyu Wu and Zhongsheng Sun. MagicViewer Integrated solution for next-generation sequencing data visualization and genetic variation detection and annotation. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2010. (IF=9.112)
Erle Zhu, Fangqing Zhao, Gang Xu, Huabin Hou, LingLin Zhou, Xiaokun Li, Zhongsheng Sun and Jinyu Wu. MirTools MicroRNA profiling and discovery based on high-throughput sequencing. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2010. (IF=9.112)
溫州醫(yī)科大學(xué)基因組醫(yī)學(xué)研究院
2017年3月17日
溫州醫(yī)科大學(xué)
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