新疆大學(xué)于20世紀(jì)60年代正式組建馬列主義教研部，90年代更名為社科部。2006年1月社科部與政治、公共管理等相關(guān)專業(yè)系合并，成立政治與公共管理學(xué)院。2011年獨(dú)立設(shè)置馬克思主義學(xué)院。
目前，學(xué)院在編教職工63人，專任教師57人，兼任教師18名。現(xiàn)設(shè)有6個(gè)教研室：馬克思主義基本原理教研室、思想道德修養(yǎng)與法律基礎(chǔ)教研室、新疆歷史與民族理論政策教程教研室、中國(guó)近現(xiàn)代史綱要教研室、毛澤東思想和中國(guó)特色社會(huì)主義理論體系概論教研室、形勢(shì)與政策教研室。設(shè)有馬克思主義理論一級(jí)學(xué)科博士點(diǎn)，博士后流動(dòng)站，馬克思主義理論、哲學(xué)一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)2個(gè)，馬克思主義民族理論與政策二級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)1個(gè)。已形成碩士、博士、博士后流動(dòng)站等較為完備的高層次人才培養(yǎng)體系。
2016年11月新疆大學(xué)馬克思主義理論學(xué)科獲批自治區(qū)“十三五”高峰學(xué)科。2017年新疆大學(xué)進(jìn)入全國(guó)“雙一流”大學(xué)建設(shè)行列，馬克思主義理論學(xué)科進(jìn)入“一流學(xué)科”建設(shè)行列。2017年12月全國(guó)第四輪學(xué)科評(píng)估結(jié)果中，馬克思主義理論位列B檔學(xué)科，排名66位，28.57%，進(jìn)入前30%。
學(xué)院有多個(gè)科研與教研平臺(tái)：“新疆大學(xué)習(xí)近平新時(shí)代中國(guó)特色社會(huì)主義思想研究中心”、“新疆意識(shí)形態(tài)安全研究中心”、 “自治區(qū)高校基層黨務(wù)工作者研修基地”。有全國(guó)高校思政理論課教學(xué)科研團(tuán)隊(duì)擇優(yōu)支持計(jì)劃1項(xiàng)、自治區(qū)優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊(duì)1個(gè)。自治區(qū)精品（重點(diǎn)）課程3門，國(guó)家級(jí)精品資源共享課1門。
近三年來，學(xué)院承擔(dān)了與馬克思主義理論相關(guān)的各級(jí)各類科研課題50余項(xiàng)，其中1項(xiàng)為教育部重大課題攻關(guān)項(xiàng)目，1項(xiàng)為國(guó)家社科基金重大項(xiàng)目（研究和闡述19大精神專項(xiàng)課題），課題研究總經(jīng)費(fèi)300萬(wàn)元。出版學(xué)術(shù)專著、教輔教材8部，在《思想理論教育導(dǎo)刊》《社會(huì)主義研究》等學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文200余篇，多篇被《人大復(fù)印報(bào)刊資料》全文轉(zhuǎn)載。獲各級(jí)各類教學(xué)科學(xué)研究獎(jiǎng)15項(xiàng)。
學(xué)院秉承“追求真理、崇尚科學(xué)、立德樹人、服務(wù)社會(huì)”的發(fā)展理念，堅(jiān)持以人才培養(yǎng)為目標(biāo)，以“立德樹人”為根本，發(fā)揮學(xué)科建設(shè)對(duì)思想政治理論課教育教學(xué)的支撐作用，教學(xué)與科研并舉、學(xué)科建設(shè)與人才培養(yǎng)并重，努力把學(xué)院建設(shè)成為與“雙一流”大學(xué)相適應(yīng)的高水平馬克思主義學(xué)院，建成在全國(guó)有重大影響力的思想政治理論教育教學(xué)基地、馬克思主義理論研究基地、馬克思主義理論高層次人才培養(yǎng)基地。