浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院導(dǎo)師:祁鳴
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浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院導(dǎo)師:祁鳴 正文
姓名:祁鳴
職稱:教授
學(xué)歷:博士研究生
專業(yè):病理學(xué)與病理生理學(xué)
所屬院系:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)系
研究方向:
遺傳與基因組醫(yī)學(xué)
個(gè)人簡(jiǎn)介
研究方向
主要研究興趣是基因突變導(dǎo)致各種疾病的機(jī)制以及相對(duì)應(yīng)的個(gè)性化治療,尤其對(duì)不同突變對(duì)藥物/食物/環(huán)境因素的反應(yīng)異同感興趣,并研究基因與運(yùn)動(dòng)能力的關(guān)系。
研究手段
1.遺傳疾病的家系分析和全基因組GWAS關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)/鑒定疾病致病基因和特殊才能基因。
2.Sanger測(cè)序法和NextGeneration高通量平行測(cè)序法發(fā)現(xiàn)/鑒定/診斷疾病致病基因,研究基因序列突變和表觀遺傳學(xué)變異的功能。
3.基因芯片研究基因拷貝數(shù)變異與疾病的關(guān)系。
4.利用Apache、Php和MySQL軟件文獻(xiàn)檢索,建立LOVD疾病基因數(shù)據(jù)庫(kù)。
5.利用細(xì)胞培養(yǎng)基因轉(zhuǎn)染、轉(zhuǎn)基因動(dòng)物和Cre-LoxP系統(tǒng)產(chǎn)生的條件性基因敲除小鼠和敲進(jìn)小鼠,研究各種臨床病人的基因突變病理機(jī)制。
在開展的課題
一.惡性室性心律失常的分子機(jī)制及心臟性猝死基因檢測(cè)
惡性室性心律失常及心臟性猝死是心血管的重大疾病。 心肌離子通道基因突變(長(zhǎng)QT間期綜合征/BRUGADA綜合征等)和肥厚性心肌病是導(dǎo)致惡性室性心律失常及心臟性猝死的兩種常見類型。在美國(guó),前者發(fā)病率約為1/5000,后者甚至更高達(dá)1/500。我國(guó)目前尚缺乏惡性室性心律失常及心臟性猝死的詳盡流行病學(xué)資料。我們按照國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)注冊(cè)登記家族性和散發(fā)性相關(guān)病人,通過建立相關(guān)全基因(6個(gè)離子通道基因,11個(gè)心肌結(jié)構(gòu)蛋白基因)篩查診斷臨床服務(wù)體系,分析基因型與表型的相關(guān)關(guān)系,探察中國(guó)人群特有的基因突變熱點(diǎn)區(qū)域和易感基因多態(tài)位點(diǎn),為進(jìn)行危險(xiǎn)分層及猝死近期預(yù)測(cè)以及基因組藥物學(xué)療效的研究提供基礎(chǔ)。大約有30%的長(zhǎng)QT間期綜合征臨床病例和40%的肥厚性心肌病臨床病例無法在已知的相關(guān)基因找到突變,提示尚有多個(gè)相關(guān)疾病基因未被發(fā)現(xiàn),我們計(jì)劃用NextGeneration高通量平行測(cè)序法繼續(xù)探索發(fā)現(xiàn)/鑒定這些惡性室性心律失常致病基因。我們利用細(xì)胞培養(yǎng)基因轉(zhuǎn)染、轉(zhuǎn)基因動(dòng)物和Cre-LoxP系統(tǒng)產(chǎn)生的條件性基因敲除小鼠和敲進(jìn)小鼠,開展電生理分析,研究各種心肌離子通道基因突變病理機(jī)制。
二.消化道腫瘤和乳腺癌的分子病理機(jī)制
癌癥與心臟病為人類的主要?dú)⑹帧_z傳性消化道腫瘤和乳腺癌是遺傳性腫瘤研究的典范。腫瘤發(fā)生為體細(xì)胞突變過程,基因突變和基因組DNA拷貝數(shù)變化為其重要的特征。不利于腫瘤生長(zhǎng)的基因(如抑癌基因)可能存在于DNA拷貝數(shù)減少的區(qū)域;而有利于腫瘤發(fā)生、發(fā)展的基因(如癌基因)可能存在于DNA拷貝數(shù)增加的區(qū)域?;蚪M變異發(fā)生于腫瘤的早期,遠(yuǎn)遠(yuǎn)早于臨床癥狀和形態(tài)學(xué)改變,同時(shí)基因組變異與腫瘤的預(yù)后及藥物反應(yīng)密切相關(guān)。通過檢測(cè)基因組DNA變異,不僅僅可發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的相關(guān)基因及其作用機(jī)制,而且還可以進(jìn)行早期診斷,并指導(dǎo)臨床個(gè)體化用藥。提高腫瘤治療療效,并降低毒副反應(yīng)的發(fā)生。
三、比較基因組雜交芯片技術(shù)在產(chǎn)前與新生兒遺傳病診斷中應(yīng)用
新生兒中約0.5%存在先天性遺傳病或出生缺陷,給社會(huì)和家庭帶來巨大的經(jīng)濟(jì)和精神負(fù)擔(dān)。美國(guó)疾病控制中心(CDC)統(tǒng)計(jì)估算,一個(gè)智障兒童一生的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)超過一百萬美元。出生缺陷是影響我國(guó)全民健康水平和人口素質(zhì)的重要問題。國(guó)家“十一五”規(guī)劃綱要將生殖健康相關(guān)技術(shù)列為科技發(fā)展優(yōu)先主題;2006-2020年國(guó)家中長(zhǎng)期規(guī)劃也將“出生缺陷防治”作為重點(diǎn)領(lǐng)域和優(yōu)先主題。我國(guó)每年約出生80~120萬缺陷嬰兒;造成經(jīng)濟(jì)損失約10億元人民幣。遺傳病是新生兒缺陷的最主要原因之一,而且許多先天性出生缺陷往往缺乏有效的治療方法,因此早期診斷和預(yù)防是目前降低出生缺陷的最有效措施。比較基因組雜交芯片(array-comparative genomic hybridization,aCGH)新技術(shù),結(jié)合了芯片和比較基因組雜交技術(shù)的優(yōu)勢(shì),省去了細(xì)胞培養(yǎng)和中期染色體制備等環(huán)節(jié),提供了快速、簡(jiǎn)便、高分辨率的全基因組范圍染色體結(jié)構(gòu)異常檢測(cè)的新技術(shù)。應(yīng)用aCGH進(jìn)行產(chǎn)前診斷,可一次性檢測(cè)超過已確定的290多種遺傳疾病,并且可以發(fā)現(xiàn)多種遺傳病相關(guān)的基因組結(jié)構(gòu)變異,從理論上探討某種遺傳病的發(fā)生機(jī)制。我們擬建立檢測(cè)孕婦外周血游離胎兒DNA的分離和檢測(cè)方法,同時(shí)設(shè)計(jì)開發(fā)診斷主要遺傳病的芯片,便于在臨床上推廣應(yīng)用,提供我國(guó)控制人口出生缺陷的新手段和新產(chǎn)品。
團(tuán)隊(duì)人員
組長(zhǎng):
祁鳴: 教授、博士生導(dǎo)師、美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)院院士
簡(jiǎn)介:
1982年于華南師大獲生物學(xué)學(xué)士學(xué)位;師從談家楨/劉祖洞,
1985年于上海復(fù)旦大學(xué)獲遺傳學(xué)于生物工程學(xué)碩士學(xué)位;
1986年考取CUSBEA第5期赴美,
1991年在美國(guó)匹茲堡大學(xué)獲分子生物學(xué)博士學(xué)位,
1998年畢業(yè)于美國(guó)西雅圖華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)主任專修班,經(jīng)全國(guó)統(tǒng)考獲取美國(guó)臨床分子遺傳學(xué)執(zhí)業(yè)執(zhí)照。歷任美國(guó)羅切斯特大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理與臨床檢驗(yàn)系助理教授、副教授,
1999年入選為美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)院院士,
2006年曾任美國(guó)哈佛大學(xué)遺傳與基因組學(xué)中心顧問,分子醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室代理主任。
目前為浙江大學(xué)遺傳與基因組醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室主任、教授,中科院北京基因組學(xué)研究所兼職研究員,美國(guó)羅切斯特大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理與臨床檢驗(yàn)系兼職副教授。2007年獲浙江省“錢江人才”資助。全國(guó)基因健康產(chǎn)業(yè)專業(yè)委員會(huì)首席專家、國(guó)際人類基因變異組計(jì)劃中國(guó)區(qū)總協(xié)調(diào)人、國(guó)際經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)基因診斷國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)專家組成員,《Human Mutation》和《ANE》等國(guó)際雜志編委,并為多種國(guó)際雜志審稿。
論文:
Yu Zhang, Bingxi Chang, Songnian Hu, Duenmei Wang, Quan Fang, Xianyong Huang, Qiang Zeng, Ming Qi, (2008) Single nucleotide polymorphisms and haplotype of four genes encoding cardiac ion channels in Chinese and their association with arrhythmia. A.N.E. 13(2):180–190.
Goldenberg I, Moss AJ, Peterson DR, McNitt S, Zareba W, Andrews ML, Robinson JL, Locati EH, Ackerman MJ, Benhorin J, Kaufman ES, Napolitano C, Priori SG, Qi M, Schwartz PJ, Towbin JA, Vincent GM, Zhang L. (2008) Risk factors for aborted cardiac arrest and sudden cardiac death in children with the congenital long-QT syndrome. Circulation. 117(17):2184-91.
Goldenberg I, Moss AJ, Bradley J, Polonsky S, Peterson DR, McNitt S, Zareba W, Andrews ML, Robinson JL, Ackerman MJ, Benhorin J, Kaufman ES, Locati EH, Napolitano C, Priori SG, Qi M, Schwartz PJ, Towbin JA, Vincent GM, Zhang L.(2008) Long-QT syndrome after age 40. Circulation. 117(17):2192-201.
PING YU, YANGSHUN GU, FAN JIN, RONGRONG HU, LILI CHEN, XIAOYI YAN, YUEHONG YANG, and MING QI (2008). Ala546Asp and Arg555Trp Mutations of TGFBI Gene and Their Clinical Manifestations in Two Large Chinese Families with Granular Corneal Dystrophy Type I. Genetic Testing, 12(3): 421-425
Kaput J, Cotton RG, Hardman L, Watson M, Al Aqeel AI, Al-Aama JY, Al-Mulla F, Alonso S, Aretz S, Auerbach AD, Bapat B, Bernstein IT, Bhak J, Bleoo SL, Blöcker H, Brenner SE, Burn J, Bustamante M, Calzone R, Cambon-Thomsen A, Cargill M, Carrera P, Cavedon L, Cho YS, Chung YJ, Claustres M, Cutting G, Dalgleish R, den Dunnen JT, Díaz C, Dobrowolski S, dos Santos MR, Ekong R, Flanagan SB, Flicek P, Furukawa Y, Genuardi M, Ghang H, Golubenko MV, Greenblatt MS, Hamosh A, Hancock JM, Hardison R, Harrison TM, Hoffmann R, Horaitis R, Howard HJ, Barash CI, Izagirre N, Jung J, Kojima T, Laradi S, Lee YS, Lee JY, Gil-da-Silva-Lopes VL, Macrae FA, Maglott D, Marafie MJ, Marsh SG, Matsubara Y, Messiaen LM, Möslein G, Netea MG, Norton ML, Oefner PJ, Oetting WS, O'Leary JC, de Ramirez AM, Paalman MH, Parboosingh J, Patrinos GP, Perozzi G, Phillips IR, Povey S, Prasad S, Qi M, Quin DJ, Ramesar RS, Richards CS, Savige J, Scheible DG, Scott RJ, Seminara D, Shephard EA, Sijmons RH, Smith TD, Sobrido MJ, Tanaka T, Tavtigian SV, Taylor GR, Teague J, Töpel T, Ullman-Cullere M, Utsunomiya J, van Kranen HJ, Vihinen M, Webb E, Weber TK, Yeager M, Yeom YI, Yim SH, Yoo HS; Contributors to the Human Variome Project Planning Meeting. Planning the human variome project: the Spain report. Hum Mutat. 2009 Apr;30(4):496-510.
Richard G. H. Cotton, Aida I. Al Aqeel, Fahd Al-Mulla, Paola Carrera, Mireille Claustres, Rosemary Ekong, Valentine J. Hyland, Finlay A. Macrae, Makia J. Mara?e, Mark H. Paalman, George P. Patrinos, MingQi, Rajkumar S. Ramesar, MSc, Rodney J. Scott, Rolf H. Sijmons, María-Jesu ´s Sobrido, Mauno Vihinen; and members of the Human Variome Project Data Collection from Clinics, Data Collection from Laboratories and Publication, Credit and Incentives Working Groups. Genet Med 2009:11(12):843–849.
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浙江大學(xué)
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