經(jīng)國務院學位委員會批準，我校于2003年開始招收MPH專業(yè)學位碩士。目前招生規(guī)?？刂圃诿磕?00名左右。 
招生對象為國民教育序列大學本科（一般應為醫(yī)藥衛(wèi)生類專業(yè)且獲得學士學位）工作滿3年，熱愛公共衛(wèi)生事業(yè)，思想素質(zhì)好，業(yè)務能力強，身體健康，各級衛(wèi)生管理、疾病控制與預防、衛(wèi)生監(jiān)督、臨床醫(yī)療單位的在職人員，有志于從事公共衛(wèi)生事業(yè)的其他專業(yè)人員。
采用理論學習、社會實踐、課題研究三結(jié)合的培養(yǎng)模式，注重培養(yǎng)解決實際問題的能力和管理才能。堅持按一級學科設置學位課程；堅持課堂教學與公共衛(wèi)生社會實踐相結(jié)合；堅持結(jié)合我國公共衛(wèi)生實際需要進行論文選題；堅持學校導師與現(xiàn)場導師共同指導的培養(yǎng)方式。
實行完全學分制。學生必須通過我校組織的規(guī)定的必修和選修課程的學習及考試，成績及格方能取得該門課程的學分；修滿規(guī)定的學分和通過必修環(huán)節(jié)方可撰寫學位論文；論文通過答辯后方能按學位申請程序授予公共衛(wèi)生碩士學位。修業(yè)年限為2－4年。
復旦MPH設有5個專業(yè)方向：

• 醫(yī)療衛(wèi)生管理 (Health Care Management)
• 疾病預防與臨床流行病學 (Disease Prevention and Clinical Epidemiology)
• 環(huán)境醫(yī)學與衛(wèi)生監(jiān)督 (Environmental Health and Supervision)
• 婦兒保健與生殖健康 (Women and Child Healthcare and Reproductive Health)
• 社區(qū)衛(wèi)生與健康促進 (Community Health and Health Promotion)