2002年學校為了加強研究生教育工作的管理和發(fā)展，成立了研究生處, 并于2006年更名為研究生部。
       研究生學院現(xiàn)設(shè)有教學培養(yǎng)科、學科建設(shè)科、學生管理科、中心實驗室、綜合辦公室四個科室，黨總支書記和院長各1名、副主任1名、教學和學生管理、中心實驗室管理人員等工作人員9名，教授3人，副教授3人，中級職稱4人。
       研究生部自2002年成立以來，通過不斷加強學科和導師隊伍的建設(shè)，進一步改善辦學條件與科學研究環(huán)境，使我校的研究生教育工作有了長足的進步。自2000年開始至今，我校二級碩士學位授予權(quán)學科已由1個增至12個，2010年又新增生物學、臨床醫(yī)學和公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學三個一級碩士學位授予權(quán)學科，新增臨床醫(yī)學碩士和公共衛(wèi)生碩士兩種專業(yè)學位，現(xiàn)有碩士生導師170多人，目前在校研究生370人。2006年獲得同等學力人員申請碩士學位授予權(quán)，并開辦了六期研究生課程進修班。
       自2005年學院將學科建設(shè)工作由研究生學院管理以來，我們積極開展學位點與學科建設(shè)各項工作，取得了良好的成效。2005年確定了19個院級重點學科、22個院級重點建設(shè)學科。2008年積極組織各院系申報自治區(qū)重點學科，經(jīng)內(nèi)蒙古自治區(qū)教育廳審核批準，我院新增3個學科自治區(qū)重點學科，2個自治區(qū)重點培育學科。我院現(xiàn)有自治區(qū)教育系統(tǒng)重點學科4個：生物化學與分子生物學、人體解剖與組織胚胎學、內(nèi)科學（心血管病）、內(nèi)科學（風濕?。?；自治區(qū)教育系統(tǒng)重點培育學科2個：生理學、藥理學；2009年自治區(qū)衛(wèi)生廳重新確定和評審領(lǐng)先學科、重點學科及重點實驗室，我校的腎內(nèi)科、消化內(nèi)科被確定為領(lǐng)先學科；神經(jīng)外科學、風濕與自體免疫病學、急診急救醫(yī)學被評為重點學科；醫(yī)學分子生物學實驗室、人體解剖學實驗室、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學實驗室被評為重點實驗室。
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