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 建立北京生命科學(xué)研究所是中國(guó)政府在發(fā)展生命科學(xué)技術(shù)領(lǐng)域的重要戰(zhàn)略之一?；驹瓌t是：把握時(shí)機(jī)，以改革試點(diǎn)的方式，采用與國(guó)際接軌的管理和運(yùn)行機(jī)制，以國(guó)際一流科學(xué)家集體為基礎(chǔ)，爭(zhēng)取在盡可能短的時(shí)間內(nèi)組建國(guó)際一流的基礎(chǔ)生命科學(xué)研究所。北京生命科學(xué)研究所的主要任務(wù)是：進(jìn)行原創(chuàng)性基礎(chǔ)研究，同時(shí)培養(yǎng)優(yōu)秀科研人才，探索新的與國(guó)際接軌而又符合中國(guó)發(fā)展的科研運(yùn)作機(jī)制。
　　對(duì)這一設(shè)想，中國(guó)領(lǐng)導(dǎo)人給予了充分肯定和支持，并為此做出重要批示。經(jīng)過(guò)多方論證和調(diào)查，由科技部、發(fā)展改革委員會(huì)、教育部、衛(wèi)生部、中國(guó)科學(xué)院、國(guó)家自然科學(xué)基金會(huì)、北京市政府、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院等8個(gè)部委為主體組成理事會(huì)，共同管理北京生命科學(xué)研究所的籌建和運(yùn)行工作。北京市政府和國(guó)家科技部負(fù)責(zé)具體實(shí)施和提供主要的資金。每屆理事會(huì)任期3年。
　　研究所實(shí)行理事會(huì)領(lǐng)導(dǎo)下的所長(zhǎng)負(fù)責(zé)制，理事會(huì)是研究所的決策機(jī)構(gòu)。第一任科學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)由理事會(huì)聘任國(guó)內(nèi)外著名科學(xué)家，組成科學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)?？茖W(xué)指導(dǎo)委員會(huì)是學(xué)術(shù)咨詢(xún)機(jī)構(gòu)，其主要任務(wù)是對(duì)研究所所長(zhǎng)進(jìn)行聘任前的學(xué)術(shù)評(píng)估，提出推薦意見(jiàn)；對(duì)研究所的研究工作做出評(píng)估并提出建議。每屆科學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)的任期為3年。
　　研究所所長(zhǎng)的聘任實(shí)行國(guó)際公開(kāi)招聘，理事會(huì)發(fā)布招聘公告，并由理事會(huì)聘請(qǐng)的科學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)進(jìn)行評(píng)估、推薦后，由理事會(huì)聘任?？萍疾颗鷾?zhǔn)所長(zhǎng)任職資格。所長(zhǎng)必須在生命科學(xué)領(lǐng)域有世界領(lǐng)先水平的科研成果，且有很高的學(xué)術(shù)造詣和國(guó)際聲譽(yù)。所長(zhǎng)任期為5年，可以連任。2003年4月，理事會(huì)聘任美國(guó)得克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心的生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)家、美國(guó)科學(xué)院院士王曉東博士，和耶魯大學(xué)植物分子生物學(xué)家鄧興旺博士為北京生命科學(xué)研究所共同所長(zhǎng)。
　　實(shí)驗(yàn)室和科研輔助中心構(gòu)成研究所科學(xué)研究工作主體，其中實(shí)驗(yàn)室為基本單位。實(shí)驗(yàn)室主任引用國(guó)際公開(kāi)招聘的制度，經(jīng)過(guò)所長(zhǎng)聘請(qǐng)的評(píng)選委員會(huì)進(jìn)行嚴(yán)格評(píng)估篩選后，由研究所所長(zhǎng)批準(zhǔn)。實(shí)驗(yàn)室主任聘任期為5年，實(shí)驗(yàn)室主任的工作將由科學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)根據(jù)其學(xué)術(shù)水平和科研成果進(jìn)行評(píng)審，同時(shí)所長(zhǎng)結(jié)合其研究工作、對(duì)研究所的綜合貢獻(xiàn)和未來(lái)發(fā)展的需要來(lái)決定其是否進(jìn)入下一期聘任。輔助中心主任由研究所所長(zhǎng)指派或聘任。
　　北京生命科學(xué)研究所英文名稱(chēng)是“NationalInstituteofBiologicalSciences,Beijing（國(guó)家生命科學(xué)研究所，北京）”。