云南農業(yè)大學機電工程學院創(chuàng)建于1972年，原為農機系，1993年更名為工程技術學院，2014年更名為機電工程學院。
學院擁有農業(yè)工程一級學科碩土點，設有農業(yè)機械化工程、農業(yè)電氣化與自動化、農業(yè)生物環(huán)境與能源工程和機械設計與制造4個二級學科碩士點（學術學位）以及農業(yè)工程與信息技術（專業(yè)學位）碩士點。學院現設六個系：農業(yè)機械工程系、機械工程系、電氣工程系、工業(yè)工程系、車輛工程系和能源與動力工程系；學院有農業(yè)機械化及其自動化、機械設計制造及其自動化、電氣工程及其自動化、工業(yè)工程、車輛工程、能源與動力工程和機械電子工程七個本科專業(yè)，其中：農業(yè)機械化及其自動化和機械設計制造及其自動化專業(yè)入選省級一流專業(yè)建設計劃，農業(yè)機械化及其自動化專業(yè)為省級特色專業(yè)并列為國家級、省級卓越工程師培養(yǎng)計劃專業(yè)，機械設計制造及其自動化專業(yè)為省級卓越工程師培養(yǎng)計劃專業(yè)；《農業(yè)機械學》、《汽車構造》和《拖拉機汽車學》等課程為省級精品課程和省級雙語示范課程。學院擁有機電工程實驗教學中心（下設32個專業(yè)實驗室）、機械制造實訓中心、農業(yè)機械陳列館和機械設計研究所等實驗實踐教學機構。此外，學院實踐教學可利用學校的基礎實驗教學中心、工科專業(yè)基礎實驗教學中心等校級實驗中心，在校外建立了14個實踐教學基地。
學院現有教師64人，其中正高級職稱9人、博士學位13人，云南省萬人計劃“產業(yè)技術領軍人才1人，云南省技術創(chuàng)新人才2人，云南省高校教師講課比賽特等獎1人。教師共主持國家級自然科學基金6項，云南省科技廳基金項目25項，教育廳科學研究基金40余項，服務于云南省農業(yè)、機械行業(yè)等橫向課題60余項。教師在《Energy》、《Biosystems Engineering》、《Transactions of the ASABE》、《農業(yè)工程學報》、《農業(yè)機械學報》等國內外核心期刊上發(fā)表論文400多篇，其中50多篇被SCI、EI、CPCI收錄；獲國家專利授權100多項。教師獲得云南省技術發(fā)明一等獎（排名第一）1項、云南省自然科學獎三等獎（排名第一）1項等7項省部級科研獎勵。
學院現有在校本科生1668人，研究生86人。學院始終把人才培養(yǎng)作為第一要務，注重學生動手能力和創(chuàng)新能力的培養(yǎng)，加強學生校內外實習、實驗和生產實踐，支持和鼓勵學生參與教師科研項目，參加全國和全省各種競賽，畢業(yè)生廣受用人單位好評，就業(yè)好。