1958年中國科學技術(shù)大學建校時就成立了高分子化學與物理系，是我國高校中第一個成立的高分子系，分為有機合成、高分子化學、高分子物理化學和高分子物理四個專業(yè)。1959年合并為高分子化學和高分子物理兩個專業(yè)。第一任系主任由北京化學所的黨委書記華壽俊兼任；第二年就由我國高分子化學的前輩王葆仁院士任系主任，并兼任高分子化學教研室主任；我國高分子物理的前輩錢人元院士任高分子物理教研室主任。隨后，高分子化學與高分子物理兩個專業(yè)先后歸屬于近代化學系、應(yīng)用化學系以及材料科學與工程系。1997年化學與材料科學學院成立，高分子系恢復(fù)建制，更名為高分子科學與工程系(簡稱高分子系)。2001年，原屬應(yīng)用化學系的輻射化學專業(yè)并入，加強了高分子系的綜合實力。近期，同屬中科大高分子學科的吳奇院士，張廣照教授，李良彬教授，閆立峰副教授等加入高分子系，從而進一步壯大了中科大高分子系的科研力量。
　　高分子系建系后的三十年內(nèi)，逐步調(diào)入和留校了一大批年富力強的老師，凝聚成了一支精悍的教師隊伍，他們研究領(lǐng)域涉及廣泛，在全國高校中屈指可數(shù)，為高分子系今天的發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。復(fù)系以來，在中科大領(lǐng)導的關(guān)心、支持和全系師生的努力下，高分子系在學科建設(shè)、科學研究和人才培養(yǎng)等諸多方面取得了快速發(fā)展，成為我國高分子學科的科學研究與人才培養(yǎng)重要基地之一。尤其2000年起，隨著中科院'創(chuàng)新工程'的實施，高分子系不斷充實力量，人才輩出；三位教授榮獲國家自然科學基金委 '杰出青年基金'資助 (張其錦教授，劉世勇教授，梁好均教授)，目前中科大高分子系共有四位國家杰出青年科學基金獲得者 (吳奇教授，張其錦教授，劉世勇教授，梁好均教授)。吳奇院士自2005年擔任Macromolecules和Langmuir雜志編委以來，于2006年初開始擔任Macromolecules雜志副主編。潘才元教授2006年1月起擔任Macromolecules雜志編委，也是國內(nèi)第一個在大分子雜志擔任編委的全職教授。因此中科大高分子學科目前共有兩位教授在高分子的頂級專業(yè)雜志Macromolecules上擔任編委或副主編。
　　高分子系現(xiàn)有中國科學院院士1名，教授16名，博士生導師14名，副教授8名；每年培養(yǎng)20-30名博士，40-50名碩士，在讀本科生約200名。每年可從應(yīng)屆畢業(yè)生中免試推薦15名以上德智體全優(yōu)的學生直接攻讀碩士、博士學位。
　　自2000年以來，高分子系先后承擔了科技部《國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展規(guī)劃》（2項973項目）、國家攀登計劃項目(2項)、國家自然科學基金委重點 (4項)和面上項目 (近30項)，國家杰出青年科學基金項目(3項)、中國科學院方向性創(chuàng)新項目(1項)、國家自然科學基金委新儀器研制項目(1項)、教育部博士點基金項目(5項)、安徽省自然科學基金項目 (10項)，以及多項與國內(nèi)外企業(yè)的合作研究和開發(fā)等重要項目，科研經(jīng)費累計超過5000萬元。2005年'大分子溶液和膠體' 教育部創(chuàng)新團隊獲審批通過。
　　獲知識產(chǎn)權(quán)局各類專利15項，而且多項發(fā)明專利已經(jīng)產(chǎn)業(yè)化，取得了可觀的經(jīng)濟效益，進而獲得了兩項國家級火炬計劃和一項國家重點火炬計劃的支持。在廣泛深入的應(yīng)用基礎(chǔ)研究的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的輻射乳液聚合制備水性乳膠漆的技術(shù)已經(jīng)進入穩(wěn)定的工業(yè)化生產(chǎn)，成為我校唯一獨資而且規(guī)?；奶胤N環(huán)保涂料生產(chǎn)基地。'紫外光交聯(lián)聚乙烯電纜新技術(shù)和新產(chǎn)品'在取得一系列理論研究成果的基礎(chǔ)上，正在實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化，已經(jīng)初具規(guī)模，為我國交聯(lián)電纜生產(chǎn)技術(shù)開拓了一條新途徑。
　　近三年來，平均每年發(fā)表SCI論文129篇，而且逐年遞增，2005年達150篇；其中影響因子大于3.0的重要論文每年發(fā)表約18篇，2005年為28篇。2006年已經(jīng)有9篇高影響因子論文發(fā)表或正式接受，其中PRL一篇。2005年，高分子系連續(xù)有兩篇論文入選Macromolecules雜志 '20 most accessed articles'。