音樂學系籌建于1997年10月，1998年開始招生。其前身為音樂理論教研室（1979年始），承擔全院所有史論公共課的教學，其時所開的課程主要有：西方音樂史、中國古代音樂史、中國近現(xiàn)代音樂史、藝術概論、中國民歌、音樂美學、音樂名作、音樂文學等。教研室成員先后有：崔其焜、關伯基、陳榮喜、許樹堅、趙婉潔、汪波、陳維綸、王潤秋、羅小平、黃虹、吳麗玲、鄧希路、胥遠帆、汪紅珺等老師。

1995年，教研室悉數(shù)并入音樂研究所，所長為：羅小平；副所長：周廣平、何平；黨支部書記為：汪波；秘書：汪紅珺、陳宏。除了研究所原有的成員（趙宋光、陳天國、羅德栽、陳安華）外，還先后增加了閆笑雨、潘瀾（2000年調離）、劉大堅、尚紅、周凱模等老師。所內教師依然承擔全院的史論類公共課。

為適應新的文化環(huán)境與社會需要，1997年開始籌建音樂學系，并從研究所中抽出部分教師獨立建制，1998年正式招生。主要人員幾乎都來自原來的音樂理論教研室，后來又逐漸增加年輕一代新教師。首任系主任：何平（2005年7月調離）；系秘書：陳宏。2005年7月，由鄧希路繼任；2006年9月，幸祝香出任黨支部書記，2012年由林鐘烈繼任，2015年4月由孫熙然繼任，2017年9月由祁斌斌繼任，2018年1月由蘇雄任黨總支書記。2020年3月祁斌斌任系主任?，F(xiàn)系部下設四個研究室：1.西方音樂史教研室；2.中國音樂史教研室；3.民族音樂教研室；4.美學教研室。目前系成員有：祁斌斌（副教授）、劉大堅（教授）、王瀝瀝（副教授）、王學佳（講師）、代宏（講師）、曲文靜（講師）、陳宏（秘書）、王覓（輔導員）、劉禹君（博士）、劉青（博士）、余亞飛（博士）、魏昇（博士）。鄧希路（返聘教授）、黃虹（返聘教授）、王少明（返聘教授）、吳麗玲（返聘教授）。

音樂學專業(yè)的辦學，定位在培養(yǎng)具有音樂學各主要學科的系統(tǒng)知識、基本學術素養(yǎng)，并掌握相應音樂表演技能的一般應用型人才與一定比例的研究型專業(yè)人才。完成這一系統(tǒng)學業(yè)的學生，將能適應專業(yè)研究部門、高等或中等專業(yè)院校及普通高校的音樂教學、廣播電視、出版機構、文化機關、文藝行業(yè)的組織管理等不同層次、不同方面的工作。同時，也為那些有志于進入更高學業(yè)階段的學生打下良好的專業(yè)基礎。

在校學生的學業(yè)，主要涉及音樂基本技能的訓練、音樂學各主要學科的系統(tǒng)知識、學術理論與治學方法、各種文體的寫作、社會調查等方面。在引導學生博覽群書、瀏覽中外音樂文化遺產的同時，著重發(fā)展學生在發(fā)現(xiàn)問題、研究問題與解決問題等方面的學術能力與表達能力。此外，為適應社會文化工作各不同層次、不同方面的需要，還致力于培養(yǎng)學生在應對日后工作時所必需的，諸如：策劃能力、組織能力、拓展能力、社交與協(xié)調能力。從2009年開始，根據(jù)國家人才培養(yǎng)策略與社會需求，探尋多層次辦學的新模式，音樂學系在專業(yè)教學方面，又細分為“理論音樂學”（五年制），與“應用音樂學”（四年制）兩個層次招生。前者著眼于培養(yǎng)研究型人才，后者著眼于培養(yǎng)應用型人才。未來，“應用音樂學”專業(yè)將作進一步規(guī)劃，細分為：音樂與健康、音樂編輯與圖書音像管理、音樂傳播三個方向。

我系自遷入大學城后，隨著學院整體教學環(huán)境的大幅度改善，教學設備的更新與添加，無疑給我們提供了從沒有過的硬件。尤其是在進一步利用多媒體手段實施教學方面更是盡如人意。

在教研文本的積累與庫存方面，我們圖書館盡管在規(guī)模、庫存量與分類結構上無法與其它大學相比，但在嶺南地區(qū)，由于本院有接近50年的辦學積累，在音樂專業(yè)文本的儲備方面還是處于領先的地位，這主要體現(xiàn)在音響、影像、圖片與各種中西樂譜、近百年出版的圖書文獻等方面。此外，由于嶺南音樂研究的主要基地就設在本院，憑著長期的積累，再加上其它機構所轉來的稀有文本，在嶺南音樂文化、乃至更廣泛的地方文史資料匯集方面更顯出我們的獨特性。再者還有那些不可忽視的教研人員的個人收藏，由于各自的專業(yè)指向不同，經(jīng)過數(shù)十年的積累，再加上老一輩學者的私傳轉藏，使得這一隱性的文本儲備意義重大，這在個別授課與研究課題的指導工作中發(fā)揮著不可低估的作用。

更為重要的是，遷進大學城之后，我們與其它不同性質的院校有了更為便捷、更為有效的接觸，這讓我們的教學更便于利用周邊院校的教育資源，這為教研人員與學生們延伸知識，拓展學術視野，增進不同學科之間的交流，促進相互間的互滲提供了便利。目前，音樂學專業(yè)的所有研究生都在院外其它學校修習一到兩門非專業(yè)課。在這方面，廣州美術學院為我們提供了熱情的支持與幫助，據(jù)了解，有幾位西方音樂史專業(yè)的研究生就在該院選修了西方美術史等課程。